Történet:

"Az átlagos emberek nem érdekelnek,ha itt akárki földönkívüli,időutazó,dimenzióugró vagy ESPer az keressen fel!Ennyi!" -Mutatkozik be az elsőéves gimnazista Suzumiya Haruhi az iskola első napján. "Biztos csak viccel"-gondolják most többen akárcsak főszereplőnk és a lány újdonsült osztálytársa Kyon (igazi neve ismeretlen). De nem.Haruhi nem viccel.Az első héten nem szól senkihez,csak,ha szólnak hozzá,naponta klubot és frizurát cserél,mert szerinte minden nap más,és mivel a fiúkat nem tartja többnek a krumpliknál elkezd mindenki előtt átöltözni az osztályteremben.Kyon-és mindenki más- ezek alapján roppant furcsának találja,így (kis noszogatás után haverjai,név szerint Taniguchi és Kunikida részéről) eldönti,hogy szóba áll vele.Amint megemlíti Haruhinak,hogy szerinte a hétfői frizura áll neki a legjobban a lány levágatja a haját és a következő naptól kezdve csak a hétfői hajpántját hordja(copfok nélkül). Egy másik beszélgetésük hatására megalapul az SOS Brigád /angolul:SOS Brigade,japánul SOS(esoesu)-Dan/,ami a különleges lények felkutatásnak céljából jött létre.Ennek a klubnak egymás után 3 tagja is lesz: a mindig morcogó Kyon,a szépségben Haruhival vetekedő másodéves Asahina Mikuru -aki egyben a klub kabalája is lesz- és a csendben olvasó Nagato Yuki később az informatika szakkör elnökének zsarolásával szereznek egy számítógépet,félév környékén pedig az állandóan mosolygó,és Haruhi őrült ötleteire mindig igent mondó negyedik tagot Koizumi Itsuki személyében.A tagok ugyan mind embernek tűnnek,de a sorozat közepe/vége felé egyre több mindent tudunk meg róluk. Lesz itt őrült ámokfutás nyusziruhában,de koncert,filmkészítés és bemutatás,sci-fi és horror paródia,és pár komolyabb jelenet is megtalálható benne.